يتمتع مجلس الإدارة بجميع السلط والصلاحيات اللازمة لإدارة الوكالة، ولهذه الغاية يضطلع على الخصوص بما يلي:
- إعداد برنامج العمل السنوي للوكالة؛
- حصر الميزانية السنوية للوكالة والبيانات التوقعية متعددة السنوات، وكذا تمويل برامج أنشطتها؛
- حصر الحسابات السنوية للوكالة، والمصادقة عليها واتخاذ قرارات تخصيص النتائج؛
- المصادقة على عقود الشراكة واتفاقيات التعاون المبرمة مع الهيئات الوطنية والأجنبية؛
- دراسة التقرير السنوي عن أنشطة الوكالة المرفوع إليه من لدن المدير؛
- وضع منظام الوكالة الذي يحدد الهياكل التنظيمية واختصاصاتها؛
- وضع النظام الأساسي الخاص بمستخدمي الوكالة ونظام تعويضاتهم؛
- اتخاذ القرار في شأن اقتناء الأملاك العقارية من لدن الوكالة أو تفويتها أو كرائها؛
- وضع نظامه الداخلي وكذا النظام الداخلي للوكالة؛
- تحديد جدول أسعار الأجرة عن الخدمات التي تقدمها الوكالة؛
- تحديد كيفيات وشروط الاستعانة بالخبراء؛
- الموافقة على قبول الهبات والوصايا التي لا يكون من شأنها المساس باستقلالية الوكالة.
ويمكن لمجلس الإدارة أن يمنح تفويضا لمدير الوكالة قصد تسوية قضايا محددة.